区别很大，本身就是两种物质，只是名称相近，就像房子和帐篷，虽然都可以住人，但其性质和功能却有很大不同。
1、物质区别：花青素是类黄酮物质，原花青素是多酚类物质。
2、性状区别：花青素是黑褐色粉末，原花青素是浅黄色粉末。
3、原料区别：花青素的原料来自果实，原花青素的原料是葡萄籽、松树皮等。
4、抗自由基：花青素对所有的自由基都有效，原花青素只对超氧离子自由基和羟基自由基有作用。
5、抗氧化性：花青素作用在人体的抗氧化能力是原花青素的60倍。